在自然周期不排卵的情况下，会影响移植效果，所以一般不建议移植胚胎。一般自然周期的排卵是由自身激素水平决定的，卵泡生长过慢而不排卵，很可能是体内激素水平达不到，可以转入人工周期。人工周期通过药物使女体内激素水平保持一个相对稳定的状态，使卵泡长到正常的粗细，从而为受卵着床做好准备。如果在自然周期中不排卵，可以以下方式转为人工周期：

1. 一般情况下，自然周期方案不排卵可以直接转人工周期进行排卵移植，使用激素类药物可以促进卵泡成熟排出，当内膜和激素达到条件后，就可以进行移植了;

2.如果自然周期不排卵，比较好暂时取消移植计划，先到医院进行全方位的身体检查，出自然周期不排卵的原因，医生会根据具体情况调整促排卵的方案;

3. 自然周期能否改为人工周期，要看患者的身体状况。如果有的患者卵巢本身就不好，即使是人工周期也无法获得优质卵子，所以也不适合改人工周期。

由此可见，自然周期不排卵与很多因素有关。一般情况下，如果出现不排卵的情况，患者首先要检查不排卵的原因，然后根据医生的指导调整方案，这样自然周期不排卵的情况就可以转为人工周期了。但需要注意的是，人工周期需要消耗雌激素，用药时间较长，是一笔不小的经济开支;而且需要服用大量药物，可能会患者带来很大的心理压力，用药后还可能会引起机体内分泌系统的某些紊乱